Domanda:
Prokka esegue traduzioni in sei frame?
Sören
2018-12-28 01:01:37 UTC
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Prokka esegue annotazioni del genoma in sei frame? La pubblicazione corrispondente non lo menziona.

Seemann, Torsten. 2014. "Prokka: annotazione rapida del genoma procariotico". Bioinformatica 30 (14): 2068–69.

Una risposta:
Chris_Rands
2018-12-28 03:42:52 UTC
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Sì, Prokka prenderà in considerazione tutti i sei frame, la predizione del gene viene effettivamente eseguita con Prodigal, paper: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2848648/

github: https://github.com/hyattpd/Prodigal



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