Ho un elenco di ID di geni / proteine e non sono riuscito a interrogare una rete utilizzando String, BioGrid, Intact e IIS, per Streptomyces thioluteus.
Il batterio con cui sto lavorando è il Streptomyces caatingaensis . Poiché è più recente di altri, ho pensato di trovare una rete di interazione alla ricerca di Streptomyces thioluteus (che condivide un percorso che sto analizzando in comune, altri non condividono). Di conseguenza, ho questo elenco di proteine, ma non sono riuscito a interrogare alcuna rete dagli ID. A volte non riuscivo a trovare il batterio negli strumenti e quando è stato trovato, come in IIS il risultato era zero interazioni.
C'è qualcosa che ho potrebbe utilizzare per avere una rete che potrebbe essere utilizzata come intuizione per l'analisi?