Bioinformatica
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Unisci centinaia di piccoli file BAM in un unico file BAM
asked 2017-05-19 10:50:24 UTC
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Come fare una distinzione tra il grafo "classico" di de Bruijn e quello descritto negli articoli di NGS?
asked 2017-05-19 15:32:45 UTC
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Fgsea e Broad Institute GSEA sono equivalenti?
asked 2017-05-19 17:32:54 UTC
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Comprensione del design, del contrasto e dei risultati di DESeq2
asked 2017-05-19 19:40:14 UTC
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Perché alcuni assemblatori richiedono un kmer di lunghezza dispari per la costruzione dei grafici di de Bruijn?
asked 2017-05-19 23:34:21 UTC
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Le basi soft-clipped vengono utilizzate per l'identificazione delle varianti in samtools + bcftools?
asked 2017-05-19 23:50:05 UTC
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Phyre2 vs ITasser, modelli completamente diversi generati
asked 2017-05-19 23:59:49 UTC
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In che modo gli algoritmi di picco stretto e picco ampio di MACS2 sono diversi?
asked 2017-05-20 05:21:09 UTC
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Dato un VCF di un genoma umano, come valuto la qualità rispetto a SNV noti?
asked 2017-05-21 02:49:51 UTC
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Come trattare l'eterozigosi durante la lucidatura dell'assemblaggio del genoma sulla base di lunghe letture?
asked 2017-05-21 16:49:59 UTC
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Distribuzione della frequenza allelica attesa degli SNV nei dati NGS reali
asked 2017-05-22 15:47:44 UTC
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Lo stato, i limiti e i confronti dei negozi di grandi varianti
asked 2017-05-22 21:14:17 UTC
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Progettazione di uno schema di database di file NGS di laboratorio
asked 2017-05-22 21:32:41 UTC
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Strumenti per la simulazione delle letture Oxford Nanopore
asked 2017-05-22 23:19:53 UTC
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Lettere maiuscole e minuscole nel genoma di riferimento
asked 2017-05-24 08:26:50 UTC
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Gli effetti della conversione incompleta del bisolfito sull'efficienza della mappatura
asked 2017-05-24 11:41:10 UTC
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Quali sono i vantaggi e gli svantaggi nell'utilizzo di KEGG o Reactome?
asked 2017-05-24 12:35:31 UTC
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Posso modellare repliche tecniche in DESeq2?
asked 2017-05-24 14:32:27 UTC
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Classificazione dei campioni in base all'espressione genica marcatore
asked 2017-05-24 20:41:28 UTC
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Come posso migliorare un assembly a lettura lunga con un genoma ripetitivo?
asked 2017-05-25 16:46:36 UTC
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Qual è la differenza tra i tipi di celle ENCODE Tier 1, 2 e 3?
asked 2017-05-25 23:21:50 UTC
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variante che richiede dati in stile ChIP-seq: samtools mpileup con filtri minimi
asked 2017-05-26 18:23:01 UTC
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Come selezionare i percorsi più rappresentativi da un'analisi di arricchimento genico?
asked 2017-05-26 19:07:00 UTC
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Come si può stimare il contributo della linea cellulare dai dati RNASeq?
asked 2017-05-30 12:30:54 UTC
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La quantificazione legge la mappatura su più loci
asked 2017-05-30 14:05:01 UTC
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Esiste un set di dati multi-omico pubblicamente disponibile?
asked 2017-05-30 17:29:00 UTC
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Rimappare le coordinate genomiche per tenere conto degli indel
asked 2017-05-30 19:35:08 UTC
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Avere motivi del DNA lunghi 6-12 punti base, cercando di ottenere punteggi di conservazione
asked 2017-05-31 02:18:08 UTC
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È possibile eseguire la sequenza di MinION offline?
asked 2017-05-31 11:22:09 UTC
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Come posso migliorare la resa delle corse di sequenziamento MinION?
asked 2017-05-31 14:48:19 UTC
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Come posso rilevare sistematicamente sequenze di codici a barre / adattatori sconosciuti all'interno di un set di campioni?
asked 2017-05-31 14:49:30 UTC
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Quali strumenti possono rilevare l'RNA chimerico (geni di fusione) dai dati WGS o RNA-Seq?
asked 2017-05-31 15:05:01 UTC
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Come trasferire le annotazioni gff nel genoma con ampie duplicazioni?
asked 2017-05-31 16:01:10 UTC
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Lavorare con vecchie build del genoma
asked 2017-06-01 01:47:18 UTC
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C'è un punto nella ricalibrazione dei punteggi per l'individuazione di varianti?
asked 2017-06-01 03:33:00 UTC
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Download di un genoma di riferimento per Bowtie2
asked 2017-06-01 03:56:27 UTC
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URL di download stabili
asked 2017-06-01 04:40:03 UTC
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Variante strutturale che richiede dati PacBio a bassa copertura
asked 2017-06-01 04:46:41 UTC
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Assegnazione di genotipi mancanti da pannelli di genotipizzazione separati
asked 2017-06-01 12:27:26 UTC
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Esistono alternative RepBase per le annotazioni di elementi di ripetizione dell'intero genoma?
asked 2017-06-01 16:11:10 UTC
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Qual è la differenza tra le versioni specifiche VCF 4.1 e 4.2?
asked 2017-06-01 16:15:56 UTC
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Come selezionare strutture di alta qualità dalla Protein Data Bank?
asked 2017-06-01 18:04:41 UTC
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Valutazione della purezza / contaminazione / miscela del tumore
asked 2017-06-01 18:08:20 UTC
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Usare shell diverse da bash
asked 2017-06-01 20:29:48 UTC
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Come viene calcolata esattamente la "lunghezza effettiva" utilizzata in FPKM?
asked 2017-06-02 00:49:22 UTC
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Geni mancanti e normalizzazione dell'output RSEM utilizzando EBSeq
asked 2017-06-02 03:57:13 UTC
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Trovare la posizione e la lunghezza dell'unità di sequenze ripetitive all'interno di una lettura lunga
asked 2017-06-02 07:48:05 UTC
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Risolutori HMM generici in bioinformatica?
asked 2017-06-02 12:13:13 UTC
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Esistono database di modelli per formati di file bioinformatici comuni?
asked 2017-06-02 19:08:50 UTC
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validazione di sottopopolazioni identificate di cellule in scRNA-seq
asked 2017-06-03 00:22:35 UTC
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