Bioinformatica
3
risposte
Convertire un file BAM da un riferimento a un altro?
asked 2017-05-17 01:00:43 UTC
7
risposte
Leggere la distribuzione della lunghezza dal file FASTA
asked 2017-05-17 09:38:52 UTC
2
risposte
Basato sull'allineamento o senza riferimento (analisi del trascrittoma)?
asked 2017-05-17 10:19:49 UTC
2
risposte
Metodi di normalizzazione con RNA-Seq ERCC spike in?
asked 2017-05-17 10:24:25 UTC
4
risposte
Come calcolare RPKM in R?
asked 2017-05-17 15:28:32 UTC
1
risposta
Come calcolare i geni sovrapposti tra due versioni di annotazione del genoma
asked 2017-05-17 16:51:45 UTC
2
risposte
Genotipizzazione a campione singolo vs articolazione
asked 2017-05-17 18:02:17 UTC
9
risposte
Come simulare le letture NGS, controllando la copertura della sequenza?
asked 2017-05-17 21:26:17 UTC
4
risposte
Come correlare due segnali simili a grafo gonfiato zero?
asked 2017-05-17 21:52:04 UTC
3
risposte
Come si costruisce un cladogramma di relazioni intraspecie?
asked 2017-05-18 00:20:52 UTC
2
risposte
Confermare il successo o il fallimento della normalizzazione RNA-Seq
asked 2017-05-18 05:28:24 UTC
5
risposte
Migliora un genoma di riferimento con i dati di sequenziamento
asked 2017-05-18 08:11:37 UTC
3
risposte
Come determinare rapidamente le mutazioni in una lettura di un file sam?
asked 2017-05-18 08:14:29 UTC
7
risposte
Come aggiornare il codice e i dati durante l'analisi?
asked 2017-05-18 14:27:51 UTC
3
risposte
mappature da sonda a sonda tra array Affymetrix
asked 2017-05-18 17:52:23 UTC
2
risposte
Come posso chiamare le varianti strutturali (SV) dai dati di risequenziamento della lettura breve a coppie?
asked 2017-05-18 19:28:48 UTC
3
risposte
Qual è il modo migliore per tenere conto dello spostamento del contenuto GC durante la costruzione di un albero filogenetico basato sui nucleotidi?
asked 2017-05-18 23:52:28 UTC
1
risposta
Come filtrare gli allineamenti incrociati da un file BED?
asked 2017-05-19 10:49:47 UTC
2
risposte
Unisci centinaia di piccoli file BAM in un unico file BAM
asked 2017-05-19 10:50:24 UTC
3
risposte
Come fare una distinzione tra il grafo "classico" di de Bruijn e quello descritto negli articoli di NGS?
asked 2017-05-19 15:32:45 UTC
2
risposte
Fgsea e Broad Institute GSEA sono equivalenti?
asked 2017-05-19 17:32:54 UTC
2
risposte
Comprensione del design, del contrasto e dei risultati di DESeq2
asked 2017-05-19 19:40:14 UTC
2
risposte
Perché alcuni assemblatori richiedono un kmer di lunghezza dispari per la costruzione dei grafici di de Bruijn?
asked 2017-05-19 23:34:21 UTC
1
risposta
Le basi soft-clipped vengono utilizzate per l'identificazione delle varianti in samtools + bcftools?
asked 2017-05-19 23:50:05 UTC
2
risposte
Phyre2 vs ITasser, modelli completamente diversi generati
asked 2017-05-19 23:59:49 UTC
1
risposta
In che modo gli algoritmi di picco stretto e picco ampio di MACS2 sono diversi?
asked 2017-05-20 05:21:09 UTC
3
risposte
Dato un VCF di un genoma umano, come valuto la qualità rispetto a SNV noti?
asked 2017-05-21 02:49:51 UTC
2
risposte
Come trattare l'eterozigosi durante la lucidatura dell'assemblaggio del genoma sulla base di lunghe letture?
asked 2017-05-21 16:49:59 UTC
1
risposta
Distribuzione della frequenza allelica attesa degli SNV nei dati NGS reali
asked 2017-05-22 15:47:44 UTC
1
risposta
Lo stato, i limiti e i confronti dei negozi di grandi varianti
asked 2017-05-22 21:14:17 UTC
3
risposte
Progettazione di uno schema di database di file NGS di laboratorio
asked 2017-05-22 21:32:41 UTC
4
risposte
Strumenti per la simulazione delle letture Oxford Nanopore
asked 2017-05-22 23:19:53 UTC
3
risposte
Lettere maiuscole e minuscole nel genoma di riferimento
asked 2017-05-24 08:26:50 UTC
1
risposta
Gli effetti della conversione incompleta del bisolfito sull'efficienza della mappatura
asked 2017-05-24 11:41:10 UTC
3
risposte
Quali sono i vantaggi e gli svantaggi nell'utilizzo di KEGG o Reactome?
asked 2017-05-24 12:35:31 UTC
2
risposte
Posso modellare repliche tecniche in DESeq2?
asked 2017-05-24 14:32:27 UTC
1
risposta
Classificazione dei campioni in base all'espressione genica marcatore
asked 2017-05-24 20:41:28 UTC
1
risposta
Come posso migliorare un assembly a lettura lunga con un genoma ripetitivo?
asked 2017-05-25 16:46:36 UTC
2
risposte
Qual è la differenza tra i tipi di celle ENCODE Tier 1, 2 e 3?
asked 2017-05-25 23:21:50 UTC
2
risposte
variante che richiede dati in stile ChIP-seq: samtools mpileup con filtri minimi
asked 2017-05-26 18:23:01 UTC
3
risposte
Come selezionare i percorsi più rappresentativi da un'analisi di arricchimento genico?
asked 2017-05-26 19:07:00 UTC
4
risposte
Come si può stimare il contributo della linea cellulare dai dati RNASeq?
asked 2017-05-30 12:30:54 UTC
1
risposta
La quantificazione legge la mappatura su più loci
asked 2017-05-30 14:05:01 UTC
3
risposte
Esiste un set di dati multi-omico pubblicamente disponibile?
asked 2017-05-30 17:29:00 UTC
2
risposte
Rimappare le coordinate genomiche per tenere conto degli indel
asked 2017-05-30 19:35:08 UTC
3
risposte
Avere motivi del DNA lunghi 6-12 punti base, cercando di ottenere punteggi di conservazione
asked 2017-05-31 02:18:08 UTC
2
risposte
È possibile eseguire la sequenza di MinION offline?
asked 2017-05-31 11:22:09 UTC
3
risposte
Come posso migliorare la resa delle corse di sequenziamento MinION?
asked 2017-05-31 14:48:19 UTC
4
risposte
Come posso rilevare sistematicamente sequenze di codici a barre / adattatori sconosciuti all'interno di un set di campioni?
asked 2017-05-31 14:49:30 UTC
2
risposte
Quali strumenti possono rilevare l'RNA chimerico (geni di fusione) dai dati WGS o RNA-Seq?
asked 2017-05-31 15:05:01 UTC
Loading...